2014年8月29日，在北京召开的国家卫生计生委2013年健康中国行和健康素养促进行动项目总结暨2014年项目启动会上，自治区疾控中心荣获2013年度全国创建无烟医疗卫生系统先进单位三等奖。

此次表彰是国家卫生计生委在2013年组织的暗访的基础上，对全国31个省（区、市）和新疆生产建设兵团的疾控中心和健康教育所创建无烟单位进行考评，评出一等奖1名，二等奖3名，三等奖6名。

自治区疾控中心在创建无烟单位活动中，领导重视，措施有力，群策群力，齐抓共管。成立了控烟工作领导小组，由中心主任亲自担任组长，每个科室负责人为领导小组成员；与每位科室主任签订相关责任状；制订了控烟考评制度及奖惩措施；控烟领导小组成员定期或不定期检查中心控烟工作；建立了控烟工作网络，做到每个科室都有一名控烟监督员和巡查员，负责对全中心范围内巡查和外来办事吸烟人员的劝阻；设立了控烟办公室，组织中心全体干部职工参加《烟草控制框架公约》和“减少烟草危害”知识讲座，并且通过展板、折页、网络等多种形式向干部职工进行控烟宣传；在中心大厅内摆放了醒目的进入无烟单位提示牌；在大楼外专门设立吸烟区；大门口、楼梯口、楼道、办公室、会议室及厕所等醒目位置都张贴了禁烟标识；所有的办公室、会议室取消烟缸、烟具；在中心门口摆放控烟知识报刊架；全体干部职工控烟知识的健康教育普及率为100%。

在自治区卫生厅2013年组织的对我区11个地（州、市）及所辖市（县）的卫生行政、公共卫生、医疗卫生等289个医疗卫生单位创建无烟单位暗访中，自治区疾控中心在被暗访的289个医疗卫生单位中以满分的成绩排名第一。