为进一步了解国务院《疫苗流通与预防接种管理条例》（以下简称条例）和卫生部《预防接种工作规范》（以下简称规范）实施情况，加强对免疫规划工作的督查和评价，2006年7月20～8月4日自治区卫生厅疾控处副处长地力夏提带领CDC有关专家，按照卫生厅关于《新疆维吾尔自治区免疫规划工作考核方案（试行）》，分别对南疆五地州的12个县（市）的卫生局、CDC、各大医院及乡（镇）卫生院的免疫规划工作进行了考核。

考核结果显示：所检查到的地（州）、县（市）对免疫规划工作的经费投入均未达到《条例》的要求。检查到的12个县（市）中有11个县（市）的乡村医生的报酬均为80元，最高达到了200元。关于中央财政转移支付的经费2004年均已落实到县一级。2005年中央财政转移支付的经费也已落实到地区一级财政部门。机构设置方面：12个县（市）中有7个县设置了免疫规划股，其中专职人员最多的达到了11人（直接承担乡级的预防接种工作）。单位和人员资质许可工作情况：12个县市的CDC在当地卫生行政部门的领导下，对辖区接种人员进行了资质培训，但对接种单位的资质尚未进行认定，接种人员的资格证书未发到个人。12个县（市）级医院2006年1～6月份的乙肝疫苗首针及时接种率平均为80.4%。冷链设备的使用、温度监测和运转情况：被检查的五个地州有4个地州都根据《条例》和《规范》的有关要求，克服经费严重不足的实际困难，从2006年1月1日起开始向县级用冷藏车送疫苗。存在的问题：一、对《条例》和《规范》贯彻落实不够全面。二、经费等保障措施未完全落实。三、免疫规划工作的机构建设不完善，尤其是在乡、村级1人身兼数职的情况较多。四、预防接种单位和人员资质认定工作尚未完成。五、流动儿童免疫规划管理工作有待进一步加强。六、产房乙肝疫苗首针及时接种率偏低。七、个别地方一类疫苗的接种继续收费。八、免疫规划工作的基础仍然很脆弱，疫苗储存、运输和使用等传统问题未从根本上得到彻底解决，目前又面临着规范化门诊的建设和定点接种等新问题。针对以上存在的问题，督导组提出了整改建议：一、加强宣传、贯彻落实《条例》和《规范》。二、争取全社会的共同的支持和参与，营造良好的社会舆论氛围，保障免疫规划工作的正常和可持续性发展。三、停止对一类疫苗的接种继续收费。四、加强培训工作，尤其是对县、乡、村级的培训，提高免疫规划工作队伍的自身建设。五.转变思想观念，采取各项针对性综合措施，实施规范化的预防接种。六、定期开展督导检查。